{"id":937,"date":"2023-11-28T02:11:22","date_gmt":"2023-11-28T02:11:22","guid":{"rendered":"https:\/\/lasstatistique.com\/?p=937"},"modified":"2024-08-14T03:15:24","modified_gmt":"2024-08-14T03:15:24","slug":"cours-0-langage-r-et-a-rstudio","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/lasstatistique.com\/?p=937","title":{"rendered":"Cours 0 : langage R et RStudio"},"content":{"rendered":"

Bref historique<\/b><\/span><\/p>\n

Au milieu des ann\u00e9es 1970, une \u00e9quipe de chercheurs men\u00e9e par John M. Chambers a d\u00e9velopp\u00e9 un langage pour \u00abprogrammer avec des donn\u00e9es\u00bb. Ce langage initialement appel\u00e9 S<\/span> a connu quatre principales versions commun\u00e9ment identi\ufb01\u00e9es par la couleur du livre dans lequel elles \u00e9taient pr\u00e9sent\u00e9es.<\/p>\n

A partir de la \ufb01n des ann\u00e9es 1980, le S<\/span> a \u00e9t\u00e9 popularis\u00e9 gr\u00e2ce \u00e0 une mise en \u0153uvre commerciale nomm\u00e9e S-PLUS<\/span>. En 2008, Lucent Technologies a vendu le langage S<\/span> \u00e0 Insightful Corporation, ce qui a e\ufb00ectivement stopp\u00e9 le d\u00e9veloppement du langage par ses auteurs originaux.<\/p>\n

Au milieu des ann\u00e9es 1990, une nouvelle mise en \u0153uvre d\u2019un langage d\u00e9velopp\u00e9 Inspir\u00e9 \u00e0 la fois par le S et par Scheme (un d\u00e9riv\u00e9 du Lisp) est faite par Ross Ihaka et Robert Gentleman qui proposent un langage pour l\u2019analyse de donn\u00e9es et les graphiques qu\u2019ils nomment R (Ihaka et Gentleman, 1996).<\/p>\n

\u00c0 la suggestion de Martin Maechler de l\u2019ETH de Zurich, les auteurs d\u00e9cident d\u2019int\u00e9grer leur nouveau langage au projet GNU, faisant de R un logiciel libre. Ainsi disponible gratuitement et ouvert aux contributions de tous, R gagne rapidement en popularit\u00e9 l\u00e0 m\u00eame o\u00f9 S-PLUS avait acquis ses lettres de noblesse, soit dans les milieux acad\u00e9miques.<\/p>\n

Installation et Pr\u00e9sentation<\/b><\/span><\/p>\n

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R<\/span> est un environnement int\u00e9gr\u00e9 de manipulation de donn\u00e9es, de calcul et de pr\u00e9paration de graphiques. le R est interpr\u00e9t\u00e9, c\u2019est-\u00e0-dire qu\u2019il requiert un autre programme (l\u2019interpr\u00e8te) pour que ses commandes soient ex\u00e9cut\u00e9es. Par opposition, les programmes de langages compil\u00e9s, comme le C<\/span> ou le C++<\/span>, sont d\u2019abord convertis en code machine par le compilateur puis directement ex\u00e9cut\u00e9s par l\u2019ordinateur. Le programme que l\u2019on lance lorsque l\u2019on ex\u00e9cute R<\/span> est en fait l\u2019interpr\u00e8te. Celui-ci attend que l\u2019on lui soumette des commandes dans le langage R<\/span>, commandes qu\u2019il ex\u00e9cutera imm\u00e9diatement, une \u00e0 une et en s\u00e9quence.<\/p>\n

Par analogie, Excel<\/span> est certes un logiciel de manipulation de donn\u00e9es, de mise enforme et de pr\u00e9paration de graphiques, mais c\u2019est aussi au sens large un langage de programmation interpr\u00e9t\u00e9. On utilise le langage de programmation lorsque l\u2019on entre des commandes dans une cellule d\u2019une feuille de calcul. L\u2019interpr\u00e8te ex\u00e9cute les commandes et a\ufb03che les r\u00e9sultats dans la cellule.<\/p>\n

L\u2019installation de R<\/span> sur Windows se fait en suivant les \u00e9tapes ci-dessous. Sous Mac Os, Unix et Linux, la proc\u00e9dure est semblable :<\/p>\n

    \n
  1. T\u00e9l\u00e9chargez le logiciel R<\/span> \u00e0 l\u2019adresse suivante : https:\/\/cran.r-project.org\/bin\/windows\/base\/<\/a><\/li>\n
  2. Ex\u00e9cutez le fichier t\u00e9l\u00e9charg\u00e9. Une fen\u00eatre de contr\u00f4le s\u2019ouvre. Cliquez sur le bouton Oui<\/b><\/span> pour autoriser l\u2019application.<\/li>\n
  3. S\u00e9lectionnez la langue de l\u2019assistant d\u2019installation et cliquez sur le bouton OK<\/b><\/span>. La fen\u00eatre de l\u2019assistant d\u2019installation de R<\/span> s\u2019ouvre et vous pouvez suivre la proc\u00e9dure d\u2019installation que vous propose l\u2019assistant.<\/li>\n<\/ol>\n

    R<\/span> est d\u2019abord et avant tout une application n\u2019o\ufb00rant qu\u2019une invite de commande du type de celle pr\u00e9sent\u00e9e \u00e0 la \ufb01gure ci-dessous. En soi, cela n\u2019est pas si di\ufb00\u00e9rent d\u2019un tableur tel que Excel<\/span> : la zone d\u2019entr\u00e9e de texte dans une cellule n\u2019est rien d\u2019autre qu\u2019une invite de commande aux capacit\u00e9s d\u2019\u00e9dition plut\u00f4t r\u00e9duites.<\/p>\n

    \"\"<\/p>\n

    Peu importe la plateforme utilis\u00e9e, il est recommand\u00e9 d\u2019interagir avec R<\/span> par le biais d\u2019un \u00e9diteur de texte pour programmeur ou d\u2019un environnement de d\u00e9veloppement int\u00e9gr\u00e9. l\u2019\u00e9dition de code R<\/span> est rendue beaucoup plus ais\u00e9e avec un bon \u00e9diteur de texte pour programmeur ou un environnement de d\u00e9veloppement int\u00e9gr\u00e9 (integrated development environment, IDE).<\/p>\n

    Dans le cadre de ce cours, nous allons adopter l\u2019environnement de d\u00e9veloppement int\u00e9gr\u00e9 Rstudio<\/span>, cr\u00e9\u00e9 sp\u00e9ci\ufb01quement pour travailler avec R<\/span>. Sa popularit\u00e9 conna\u00eet une progression foudroyante depuis 2014. Il permet de consulter dans une interface conviviale ses \ufb01chiers de script, la ligne de commande R<\/span>, les rubriques d\u2019aide, les graphiques, etc. Donc apr\u00e8s avoir install\u00e9 R<\/span>, il est n\u00e9cessaire de t\u00e9l\u00e9charger et d\u2019installer l\u2019environnement Rstudio<\/span> qui nous permettra de produire nos scripts R<\/span>. Pour le faire, il faut :<\/p>\n